Sel tumbuhan biasanya dikulturkan dalam media yang mempunyai pH berkisar antara 5-6. Dilaporkan oleh beberapa peneliti bahwa pH media pertumbuhan secara nyata berpengaruh terhadap produksi metabolit sekunder, misalnya pada biosintesis antosianin, antrakinon, dan alkaloid.
Sebagai salah satu contoh misalnya produksi antosianin dalam kultur sel Daucus carota yang dikulturkan pada pH 5,5 akan dihasilkan antosianin yang lebih rendah dari pada pada pH 4,5.