Komposisi metabolit sekunder dalam kultur suspensi sel dipengaruhi oleh pemberian oksigen, tetapi sangat sedikit publikasi mengenai ‘stress’ oksigen terhadap produksi metabolit sekunder. Dalam bidang lain , yaitu pada produksi metabolit sekunder oleh khamir pada kondisi kekurangan oksigen (anaerobik) telah dirangkum dalam berbagai laporan.
Aktivitas alkohol dehidrogenase, malatdan nitrat reduktase akan meningkat dalam kondisi anoksia (kekurangan oksigen). Peniadaan oksigen akan terlihat j’elas pada kenaikan aktivitas glikolisis yang akan mendorong akumulasi etanol.
Kadar asam amino bebas meningkat dalam kultur sel Acer pseudoplatanus bila kadar karbon dioksida dinaikkan dan penyediaan udara diturunkan. Contoh lain, pada suspensi sel “mungbean” akan terjadi glikosilasi isoflavon (daidzein) dengan lancar bila ditumbuhkan tanpa oksigen.